Concebida desde la idea de ofrecer los avances de los estudios árabes en España y completar la historia publicada cuarenta años antes por el holandés Dozy, Codera publica Decadencia y desaparición de los almorávides en España en la "Colección de Estudios Árabes", dirigida por su discípulo Julián Ribera. Obra de madurez, elaborada a lo largo de una veintena de años, se trata de una monografía ejemplar, en la que destaca su modélica introducción donde, desde su lúcido positivismo, señala cómo se venía escribiendo y cómo debía escribirse la historia de al-Ándalus, y la excelente y segura narración de los intrincados acontecimientos políticos de pleno siglo XII, esclareciéndolos desde los textos y la numismática.
